De acuerdo con la BBC, Mary Ellis formó parte del servicio Auxiliar de Transporte Aéreo (ATA), una organización civil que transportaba los aviones de combate.
De los 1,320 pilotos, 168 eran mujeres. Mary Ellis dirigió mil naves en diversos momentps, incluido el Spitfire. Ella misma declaró en 2017 que éste era su avión favorito y que era un "sinónimo de libertad".
La piloto se unió al ATA después de escuchar un anuncio de radio que se transmitió justamente en la BBC.
Mary Ellis destacó que durante la guerra eran conocidas como las "Glamour Girls", y destacaban por ser pocas mujeres en un grupo en el que predominaban los hombres.